Có những lúc nguyên nhân gây sốt cho cún cưng không thể xác định được; đây được gọi là "cơn sốt không rõ nguồn gốc" hay FUO. Các nguyên nhân có khả năng nhất gây sốt chó không rõ nguồn gốc là rối loạn hệ thống miễn dịch, các vấn đề về tủy xương, nhiễm trùng không được chẩn đoán và ung thư.
