Định nghĩa lại các loại ung thư đại trực tràng
Từ trước tới nay mọi người điều cho rằng ung thư đại trực tràng (CRC), gây ra khoảng 50.000 ca tử vong ở Hoa Kỳ mỗi năm, có thể được phân loại thành các phân nhóm phân tử riêng biệt. Và trong một bài báo được xuất bản gần đây trên tạp chí Genome Biology, Giáo sư Levi Waldron cùng cộng sự đã thách thức những giả định cơ bản này và đề xuất một phương pháp mới giúp xác định các khối u được phân biệt tốt hơn ở những bệnh nhân có thể khác nhau về phơi nhiễm, kết quả và phương pháp điều trị tối ưu.
Và trong nghiên cứu này, các tác giả đã tái xử lý và chuẩn hóa dữ liệu biểu hiện gen của từng trường hợp cho hơn 3.700 bệnh nhân từ 18 nghiên cứu đã được công bố, qua đó tạo ra cơ sở dữ liệu được chuẩn hóa, và được sắp xếp lớn nhất của CRC "transcriptome (là tập hợp của tất cả các phân tử RNA trong một tế bào hoặc một quần thể tế bào)" cho đến nay. Ngoài ra các tác giả đầu tiên đã cố gắng xác nhận các phân nhóm được chấp nhận rộng rãi của CRC và không tìm thấy bất cứ bằng chứng nào để hỗ trợ những loại phụ riêng biệt này hay các dạng phụ khác của CRC "transcriptome" hoặc kết hợp biểu hiện của tất cả các gen.
Định nghĩa lại các loại ung thư đại trực tràng.
Các tác giả sau đó đã đề xuất một phương pháp mới được sử dụng một cơ sở dữ liệu để xác định phân nhóm riêng biệt hoặc điểm liên tục nhằm cung cấp các biện pháp đơn giản của transcriptome. Và họ đã sử dụng nó để xác định 2 điểm số tốt hơn so với những đặc trưng trong một chuỗi liên tục của CRC transcriptomes. Với những phiên bản này cho thấy phù hợp với các phân nhóm được thành lập trước đây, nhưng tốt hơn và đại diện cho sự biến đổi riêng lẻ của CRC hơn là phân nhóm riêng biệt. Và điểm số ở đây là những yếu tố dự đoán tốt hơn vị trí khối u, giai đoạn, mức độ và thời gian sống sót của bệnh, hoặc có thể được hiểu là đại diện cho hoạt động sinh học bao gồm cả viêm và hoạt động miễn dịch.
Waldron nói: Nghiên cứu này giúp kiểm tra lại những phương pháp đã được sử dụng rộng rãi để xác định các loại ung thư trên nhiều lĩnh vực nghiên cứu ung thư qua đó có thể thấy rằng những phương pháp này có thể xác định những khối u không tồn tại trong quá trình cần xác nhận thêm. Tuy nhiên điều thú vị nhất ở nghiên cứu này là nó cung cấp một phương pháp mới qua đó có thể tận dụng những cơ sở dữ liệu được công bố rộng rãi trong nhóm bệnh nhân thuần tập và kỹ thuật. Ngoài ra sự vững mạnh của hệ thống tính điểm được chúng tôi đề xuất rất rõ ràng và khó có thể tranh chấp. Và tất nhiên tôi mong muốn áp dụng phương pháp này ngay bây giờ cho các loại ung thư khác và trong những cơ sở dữ liệu lớn hơn hiện có, qua đó có thể hiểu rõ hơn về khối u tương tự khác và chúng khác nhau như thế nào.