Cancer-Immu: Cổng dữ liệu giúp dự đoán các đáp ứng với liệu pháp miễn dịch ức chế điểm kiểm soát miễn dịch

Nguồn: CC0 Public Domain

Một cổng dữ liệu mới được gọi là Cancer-Immu do một nhóm các nhà thống kê sinh học của Trung tâm Y tế Đại học Vanderbilt thành lập có thể giúp các bác sĩ và nhà nghiên cứu ung thư dự đoán bệnh nhân nào sẽ phản ứng với các chất ức chế điểm kiểm soát miễn dịch. Với dữ liệu từ 3.652 mẫu cho 16 loại ung thư, Cancer-Immu là cổng dữ liệu liên quan đến ức chế điểm kiểm soát miễn dịch lớn nhất để khám phá liên kết giữa các gen miễn dịch.

Nhóm nghiên cứu cung cấp thông tin chi tiết về cổng truy cập mở trong một bài báo được xuất bản ngày 13 tháng 12 trên Tạp chí Nghiên cứu Ung thư. Cancer-Immu tích hợp dữ liệu đa chiều quy mô lớn, bao gồm quá trình phiên mã số lượng lớn tế bào đơn di truyền, dữ liệu về di truyền động lực học hệ protein và hệ gen. Ngoài ra còn tích hợp các kiểu hình lâm sàng.

Thuốc ức chế điểm kiểm soát miễn dịch có thể cứu sống một số bệnh nhân ung thư, nhưng hầu hết bệnh nhân không đáp ứng với liệu pháp miễn dịch. Các nhà nghiên cứu đang tìm kiếm các dấu ấn sinh học nhằm giúp dự đoán đáp ứng của bệnh nhân và Cancer-Immu cung cấp một cổng chức năng toàn diện để làm sáng tỏ các liên kết gen miễn dịch.

Cancer-Immu cung cấp khả năng truy cập dễ dàng vào dữ liệu sinh miễn dịch và cho phép các nhà nghiên cứu dịch các bộ dữ liệu omics (nghiên cứu gen và chức năng gen) thành những hiểu biết sinh học và ứng dụng lâm sàng. Cancer-Immu chứa các bộ dữ liệu và các loại dữ liệu omics nhiều hơn hẳn so với các cơ sở dữ liệu hiện có cùng kết quả tìm kiếm đáp ứng với thuốc ức chế điểm kiểm soát miễn dịch.

Các loại ung thư trong cổng dữ liệu bao gồm u ác tính, ung thư phổi không phải tế bào nhỏ, ung thư biểu mô di căn, ung thư biểu mô tế bào thận, ung thư bàng quang, u thần kinh đệm, ung thư đại trực tràng, ung thư đầu cổ, ung thư thực quản, ung thư nguyên phát không rõ nguyên nhân, ung thư dạ dày, ung thư vú, ung thư biểu mô tế bào gan, ung thư tuyến tiền liệt, ung thư biểu mô tế bào đáy và ung thư da không hắc tố.

Với cổng dữ liệu Cancer-Immu, các bác sĩ và nhà nghiên cứu có thể tải lên và phân tích dữ liệu của riêng họ hoặc đồng thời phân tích với dữ liệu hiện có. Họ có thể chọn phân tích tổng hợp hoặc phân tích ung thư toàn thân. Cổng thông tin bao gồm ba loại dữ liệu omics: dữ liệu di truyền, bộ phiên mã và dữ liệu tế bào đơn. Với chế độ phân tích ung thư toàn thân, tổng hợp nhiều bộ dữ liệu thành một, giúp tăng cường khả năng phát hiện và phân tích các trường hợp hiếm gặp. Các nhà nghiên cứu nhận thấy rằng phân tích tổng hợp - đánh giá thống kê các nghiên cứu độc lập nhưng cùng một câu hỏi - không phát hiện được các đột biến gen quan trọng, còn phân tích ung thư toàn thân, một đánh giá mở rộng hơn trên nhiều loại ung thư thì có thể phát hiện được 182 gen có đột biến liên quan đáng kể với các chất ức chế điểm kiểm soát miễn dịch.

Cancer-Immu giúp giải quyết sự thiếu hụt và thách thức trong việc đánh giá hiệu quả của các dấu ấn sinh học đã biết cũng như khám phá ra các dấu ấn mới.

Thông tin thêm: Jing Yang và cộng sự, Bản đồ gen miễn dịch ung thư toàn thân cho liệu pháp miễn dịch ức chế điểm kiểm soát miễn dịch, Nghiên cứu Ung thư (2021). DOI: 10.1158 / 0008-5472.CAN-21-2335
Cancer-Immu: 129.59.197.30:3838/Cancer-Immu/